Stephen được phát hiện đã tắt thở ngày 10 tháng 10 tại Mallorca, Tây Ban Nha[10]. Trước đó, vào tối 5 tháng 10, Stephen còn xuất hiện với trạng thái rất khỏe mạnh, tỉnh táo cùng người đồng nghiệp Ronan Keating tại lễ trao giải Pride Of Britain của đài ITV1. Đây có thể xem là lần xuất hiện cuối cùng trong cuộc đời của Stephen trước công chúng. Trên trang Twitter, vào ngày 6 tháng 10, Stephen Gately đã viết: "Tôi vẫn rất bận rộn, còn nhiều việc phải làm. Tôi phải tập trung hoàn thành cuốn sách của mình, ở đây thật yên bình".[11] Tối 9 tháng 10, Stephen và bạn trai Andy Cowles đã mời một người đàn ông quốc tịch Bungary có tên Giorgio tới căn hộ của mình nằm trong khu nghỉ dưỡng Port Andratx phía tây nam Mallorca, sau khi cả ba gặp gỡ tại hộp đêm Black Cat đêm đó. Đến 13h45 chiều ngày 10/10 (giờ địa phương), thi thể của Stephen Gately mới được Andy Cowles phát hiện ra. Andy Cowles cố gắng cứu sống Stephen bằng vài biện pháp hồi sức cấp cứu, song mọi nỗ lực của Andy đều không mang lại kết quả. Stephen đã chết từ trước đó. Kết quả khám nghiệm tử thi cho biết anh qua đời do bị tràn dịch màng phổi dẫn tới ngạt thở, suy tim.[10]

Các thành viên còn lại của Boyzone đã đưa thi thể Stephen Gately về quê nhà Ireland, gia đình đã tổ chức đám tang cho anh tại nhà thờ St Laurence O'Toole, thành phố Dublin. Ireland tối ngày 16 tháng 10. Tang lễ đã được tổ chức ngày 17 tháng 10 với rất đông bạn bè, người hâm mộ đến đưa tiễn. Ngoài các thành viên còn lại của Boyzone, còn có sự theo dõi của hàng nghìn khán giả hâm mộ và những người bạn thân thiết của Stephen Gately trong làng giải trí như nhà sản xuất - Louis Walsh, các thành viên nhóm Westlife, Brian McFadden, Shayne Ward Ward, Sharon Corr, Jason Donovan, George Michael, vợ chồng David và Victoria Beckham, Simon Cowell, nhóm Take That, nhóm U2, Robbie Williams, Cheryl Cole, Sharon Osborne, Colin Farrell…[12][13][14]